ľ¹Ï¸£ÀûÓ°ÊÓ

Samenvatting

De cellen in ons lichaam bevatten hetzelfde DNA, maar zien er anders uit en functioneren anders. Dit kan onder meer worden toegeschreven aan de manier waarop het DNA is opgevouwen in de bolvormige kern, in het midden van de cel. Onderzoek toont aan dat dicht opeengepakt DNA over het algemeen niet door de cel wordt gebruikt en zich nabij de kernwanden bevindt. Het open DNA daarentegen, word "gelezen" door de cel en bevindt zich in het midden van de kern. Tot nu toe kon dit echter niet worden bevestigd omdat een techniek ontbrak om zowel de DNA-vouwing als de actieve DNA-regio's van dezelfde cel te meten. Eencellige resolutie is belangrijk om de twee metingen rechtstreeks te koppelen. We hebben dit probleem aangepakt door scDam&T-seq te ontwikkelen, een methode die de vouwing van het DNA in de kern kan bepalen en tegelijkertijd kan meten of het DNA door de cel wordt gebruikt of niet. Bovendien kan scDam&T-seq dit meten in één cel in tegenstelling tot miljoenen cellen, waardoor we konden bevestigen dat het meeste DNA dat zich op de wand van de kern bevindt, inactief is. We ontdekten ook dat sommige DNA-regio's waarschijnlijker worden geïnactiveerd bij beweging naar de nucleaire wand dan andere. We pasten scDam T-seq toe op muizenhersenen in ontwikkeling en onthulden de DNA-vouwing van cellen die neuronen genereren. Het werk in dit proefschrift biedt voornamelijk technische oplossingen die het mogelijk maken om tegelijkertijd DNA-vouwing en DNA-activiteit te bestuderen.